新疆生物资源基因工程重点实验室于2002年4月经自治区人民政府批准成立，2003年1月被科技部挂牌“省部共建新疆生物资源基因工程国家重点实验室培育基地”。实验室立足新疆特色生物资源，瞄准国家和自治区生物产业和生物医药重大需求，围绕“生物资源保护与利用”主题，通过“新疆生物资源调查及保护生物学”、“新疆特殊环境生物抗逆机制与生态响应研究”和“新疆特色生物资源开发利用”三个方向开展基础、应用研究和成果转化。自成立以来实验室科研团队依托重点实验室良好的研究环境先后荣获国家级教学成果二等奖1项、自治区级教学成果一等奖1项，自治区科技进步一等奖1项、二等奖4项，三等奖2项。

实验室现有研究人员71人，其中中组部“青年千人”1人，NSFC-新疆联合基金本地优青2人，以及一个自治区合成生物学与微生物代谢工程创新团队。

实验室现有实验用房5700平方米，实验设备固定资产3444万元，拥有10万元以上仪器设备82台，涵盖生物大分子分离与检测、生物功效成分提取与检测、细胞分选与检测、荧光数码显微分析、小动物活体成像分析、食品分析与检测和微生物菌种鉴定与发酵等，实验室所有设备面向社会开放、共享和有偿使用。通过建设，实验室将成为新疆生物资源综合利用领域集科学研究、技术开发、成果转化、高层次人才培养、国际交流为一体，服务于自治区农业、畜牧业及大健康产业发展，辐射中亚的重要科研与教学基地，为自治区社会与经济发展持续培养生物医学高素质、创新型人才。